Victor Kossakovsky ha iniziato la sua carriera nel cinema nel 1978 presso lo Studio di Documentari di Leningrado (oggi San Pietroburgo), dove ha lavorato come assistente operatore, aiuto regista e montatore. Nel 1988 si è diplomato ai Corsi Superiori per Sceneggiatori e Registi di Mosca.
Il suo primo lungometraggio, Belovy (The Belovs, 1992), ha vinto sia il VPRO Joris Ivens Award sia il Premio del Pubblico all'IDFA nel 1993.
Successivamente ha realizzato i film Wednesday 19.07.1961 (1997), Pavel and Lyalya (199...visualizza tutto99), I Loved You... (2001), Tishe! (2003), ¡Vivan Las Antipodas! (2011), Demonstration (2013), Aquarela (2018), Gunda (2020), Architecton (2024) e Trillion (2025).
I film di Kossakovsky hanno ottenuto oltre cento riconoscimenti internazionali e sono stati presentati in decine di festival in tutto il mondo, tra cui la Mostra Internazionale d'Arte Cinematografica di Venezia, il Sundance Film Festival e la Berlinale, dove nel 2024 ha presentato in Concorso Architecton.
Tishe!, ¡Vivan Las Antipodas! e Gunda sono stati candidati agli European Film Awards come Miglior Documentario.
Aquarela e Gunda sono inoltre entrati nella shortlist degli Academy Awards® nella categoria Miglior Documentario.
